MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009484	GGC	2	6	196160	196165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259189
5002	NC_009484	CCGCGC	2	12	196169	196180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259189
5003	NC_009484	GCCC	2	8	196192	196199	0 %	0 %	25 %	75 %	148259189
5004	NC_009484	TGC	2	6	196223	196228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259189
5005	NC_009484	AGC	2	6	196251	196256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259189
5006	NC_009484	CGG	2	6	196271	196276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259189
5007	NC_009484	CAG	2	6	196277	196282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259189
5008	NC_009484	CG	4	8	196330	196337	0 %	0 %	50 %	50 %	148259189
5009	NC_009484	GGC	2	6	196346	196351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259189
5010	NC_009484	GC	3	6	196350	196355	0 %	0 %	50 %	50 %	148259189
5011	NC_009484	GAACCG	2	12	196381	196392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259189
5012	NC_009484	CAG	2	6	196427	196432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259189
5013	NC_009484	GCG	2	6	196458	196463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259189
5014	NC_009484	AGC	2	6	196464	196469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259189
5015	NC_009484	GC	3	6	196468	196473	0 %	0 %	50 %	50 %	148259189
5016	NC_009484	TCG	2	6	196477	196482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259189
5017	NC_009484	CG	3	6	196492	196497	0 %	0 %	50 %	50 %	148259189
5018	NC_009484	GC	3	6	196526	196531	0 %	0 %	50 %	50 %	148259189
5019	NC_009484	CAG	3	9	196532	196540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259189
5020	NC_009484	CGG	2	6	196633	196638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259189
5021	NC_009484	TCG	2	6	196656	196661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259189
5022	NC_009484	CGGCG	3	15	196730	196744	0 %	0 %	60 %	40 %	148259189
5023	NC_009484	CGC	2	6	196783	196788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259189
5024	NC_009484	CGG	3	9	196804	196812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259189
5025	NC_009484	GCG	2	6	196816	196821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259189
5026	NC_009484	GCC	2	6	196836	196841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259189
5027	NC_009484	ATC	2	6	196854	196859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259189
5028	NC_009484	CCA	2	6	196879	196884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259189
5029	NC_009484	CGG	3	9	196888	196896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259189
5030	NC_009484	CGG	2	6	196912	196917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259189
5031	NC_009484	ATG	2	6	196920	196925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259189
5032	NC_009484	GATC	2	8	196948	196955	25 %	25 %	25 %	25 %	148259189
5033	NC_009484	CG	3	6	196991	196996	0 %	0 %	50 %	50 %	148259189
5034	NC_009484	CTG	2	6	197016	197021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259189
5035	NC_009484	TCCT	2	8	197028	197035	0 %	50 %	0 %	50 %	148259189
5036	NC_009484	GCG	2	6	197074	197079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_009484	G	6	6	197137	197142	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_009484	GC	3	6	197154	197159	0 %	0 %	50 %	50 %	148259190
5039	NC_009484	GGC	2	6	197193	197198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259190
5040	NC_009484	GAAC	2	8	197201	197208	50 %	0 %	25 %	25 %	148259190
5041	NC_009484	CGG	2	6	197255	197260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259190
5042	NC_009484	CAG	2	6	197369	197374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259190
5043	NC_009484	GCG	2	6	197413	197418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259190
5044	NC_009484	CG	3	6	197417	197422	0 %	0 %	50 %	50 %	148259190
5045	NC_009484	GCC	2	6	197438	197443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259190
5046	NC_009484	CGAC	2	8	197470	197477	25 %	0 %	25 %	50 %	148259190
5047	NC_009484	CGC	2	6	197499	197504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259190
5048	NC_009484	CG	3	6	197560	197565	0 %	0 %	50 %	50 %	148259190
5049	NC_009484	CGG	2	6	197579	197584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259190
5050	NC_009484	GCT	2	6	197644	197649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_009484	GAA	2	6	197676	197681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259191
5052	NC_009484	ATC	2	6	197695	197700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259191
5053	NC_009484	TCG	2	6	197717	197722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259191
5054	NC_009484	GCC	2	6	197725	197730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259191
5055	NC_009484	GCG	2	6	197746	197751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259191
5056	NC_009484	CGG	2	6	197769	197774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259191
5057	NC_009484	GC	3	6	197790	197795	0 %	0 %	50 %	50 %	148259191
5058	NC_009484	GCA	2	6	197804	197809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259191
5059	NC_009484	CTCG	2	8	197877	197884	0 %	25 %	25 %	50 %	148259191
5060	NC_009484	AGC	2	6	197950	197955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259191
5061	NC_009484	GCG	2	6	197956	197961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259191
5062	NC_009484	GCT	2	6	197976	197981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259191
5063	NC_009484	CGG	2	6	198009	198014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259191
5064	NC_009484	GCT	2	6	198081	198086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259191
5065	NC_009484	CGG	3	9	198141	198149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259191
5066	NC_009484	CGT	2	6	198194	198199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259192
5067	NC_009484	TGG	2	6	198202	198207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259192
5068	NC_009484	GGT	2	6	198260	198265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259192
5069	NC_009484	CCCG	2	8	198281	198288	0 %	0 %	25 %	75 %	148259192
5070	NC_009484	GC	3	6	198322	198327	0 %	0 %	50 %	50 %	148259192
5071	NC_009484	GCG	2	6	198376	198381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259192
5072	NC_009484	CGC	2	6	198421	198426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259192
5073	NC_009484	GCC	2	6	198431	198436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259192
5074	NC_009484	ATC	2	6	198519	198524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259192
5075	NC_009484	GC	3	6	198553	198558	0 %	0 %	50 %	50 %	148259192
5076	NC_009484	GTC	2	6	198582	198587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259192
5077	NC_009484	GCC	2	6	198602	198607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259192
5078	NC_009484	CGGCA	2	10	198633	198642	20 %	0 %	40 %	40 %	148259192
5079	NC_009484	GGCT	2	8	198666	198673	0 %	25 %	50 %	25 %	148259192
5080	NC_009484	GTG	2	6	198699	198704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259192
5081	NC_009484	GTT	2	6	198736	198741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259192
5082	NC_009484	GCTG	2	8	198744	198751	0 %	25 %	50 %	25 %	148259192
5083	NC_009484	CGG	2	6	198816	198821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_009484	TGC	2	6	198933	198938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259193
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5086	NC_009484	GGC	2	6	198965	198970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259193
5087	NC_009484	CCG	2	6	198984	198989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259193
5088	NC_009484	TCGGCA	2	12	199015	199026	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148259193
5089	NC_009484	GGC	2	6	199080	199085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259193
5090	NC_009484	CTG	2	6	199089	199094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259193
5091	NC_009484	TTC	2	6	199173	199178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259193
5092	NC_009484	AAC	2	6	199182	199187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259193
5093	NC_009484	CGA	2	6	199199	199204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259193
5094	NC_009484	GGC	2	6	199383	199388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259193
5095	NC_009484	GTGCC	2	10	199519	199528	0 %	20 %	40 %	40 %	148259193
5096	NC_009484	GCC	2	6	199607	199612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259193
5097	NC_009484	CGGCTC	3	18	199648	199665	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259193
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5100	NC_009484	GCA	2	6	199724	199729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259193
5101	NC_009484	GGC	2	6	199742	199747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259193
5102	NC_009484	TGAACG	2	12	199780	199791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148259193
5103	NC_009484	ACA	2	6	199822	199827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259193
5104	NC_009484	CG	3	6	199845	199850	0 %	0 %	50 %	50 %	148259193
5105	NC_009484	GGC	2	6	199859	199864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259193
5106	NC_009484	GAA	2	6	199889	199894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259193
5107	NC_009484	CCG	2	6	199970	199975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259193
5108	NC_009484	ATC	2	6	199983	199988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259193
5109	NC_009484	CGGAT	2	10	200008	200017	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5110	NC_009484	CGG	2	6	200028	200033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_009484	T	7	7	200044	200050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_009484	CGT	2	6	200075	200080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_009484	CCT	2	6	200158	200163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_009484	GAG	2	6	200239	200244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_009484	GGC	2	6	200276	200281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259194
5116	NC_009484	ATC	2	6	200286	200291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259194
5117	NC_009484	CGG	3	9	200311	200319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259194
5118	NC_009484	ACA	2	6	200368	200373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259194
5119	NC_009484	TCGG	2	8	200472	200479	0 %	25 %	50 %	25 %	148259194
5120	NC_009484	GC	3	6	200560	200565	0 %	0 %	50 %	50 %	148259194
5121	NC_009484	GGT	2	6	200570	200575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259194
5122	NC_009484	GC	4	8	200713	200720	0 %	0 %	50 %	50 %	148259194
5123	NC_009484	CGA	2	6	200891	200896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259194
5124	NC_009484	CAA	2	6	200900	200905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259194
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5232	NC_009484	CGA	2	6	204727	204732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259199
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5240	NC_009484	GGCGCG	2	12	205027	205038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5241	NC_009484	CG	3	6	205049	205054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5242	NC_009484	CCGA	2	8	205056	205063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5243	NC_009484	GGA	2	6	205070	205075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_009484	GCA	2	6	205152	205157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259200
5245	NC_009484	TCG	2	6	205158	205163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259200
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5363	NC_009484	ACCGCG	2	12	209048	209059	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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5367	NC_009484	GGC	2	6	209146	209151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259204
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5369	NC_009484	GCTC	2	8	209252	209259	0 %	25 %	25 %	50 %	148259204
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5458	NC_009484	CAGC	2	8	212270	212277	25 %	0 %	25 %	50 %	148259205
5459	NC_009484	CTGC	2	8	212309	212316	0 %	25 %	25 %	50 %	148259205
5460	NC_009484	CGGGC	2	10	212343	212352	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5461	NC_009484	CGG	2	6	212365	212370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259206
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5477	NC_009484	CGGC	2	8	212922	212929	0 %	0 %	50 %	50 %	148259206
5478	NC_009484	CTTC	2	8	213055	213062	0 %	50 %	0 %	50 %	148259206
5479	NC_009484	TCG	2	6	213072	213077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259206
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5484	NC_009484	GGC	2	6	213208	213213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259206
5485	NC_009484	GCG	2	6	213242	213247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259206
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5487	NC_009484	GCC	3	9	213290	213298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259206
5488	NC_009484	GGCG	2	8	213317	213324	0 %	0 %	75 %	25 %	148259206
5489	NC_009484	TGCC	2	8	213385	213392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5490	NC_009484	A	6	6	213397	213402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_009484	CAG	2	6	213461	213466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5492	NC_009484	TTG	2	6	213500	213505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_009484	GC	3	6	213536	213541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5494	NC_009484	GAT	2	6	213580	213585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259207
5495	NC_009484	CCG	2	6	213591	213596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259207
5496	NC_009484	GCG	2	6	213637	213642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
5497	NC_009484	GAG	2	6	213646	213651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259207
5498	NC_009484	GTC	2	6	213751	213756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259207
5499	NC_009484	ATGGC	2	10	213853	213862	20 %	20 %	40 %	20 %	148259207
5500	NC_009484	TCG	2	6	213866	213871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259207

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